सीएसआईआर-सीएसआईओ भी एम.टेक(मेकाट्रोनिक्स) कार्यक्रम चलाने के लिए बंगाल साइंस एंड इंजीनियरिंग विश्वविद्यालय, शिबपुर (बीईएसयू) का हिस्सा हे, जो कि सीएसआईआर की दो अन्य प्रयोगशालाओं के साथ मिलकर जेसे दुर्गापुर में सीएसआईआर-सेंट्रल मैकेनिकल इंजीनियरिंग रिसर्च इंस्टीट्यूट (सीएसआईआर-सीएमईआरआई) और सीएसआईआर-सेंट्रल इलेक्ट्रॉनिक्स इंजीनियरिंग रिसर्च इंस्टीट्यूट (सीएसआईआर-सीरी). दूसरे सेमेस्टर के दौरान छात्र छह सप्ताह की अवधि के लिए सीएसआईआर-सीएसआईओ में दो आवासीय, पूर्णकालिक पाठ्यक्रममें भाग लेते हैं, इसके अतिरिक्त, हर बैच के कुछ छात्र एमटेक कार्यक्रम के अंतिम वर्ष के दौरान अपना पूरा समय, आवासीय परियोजनाओं को करने का विकल्प चुनते हैं।. 2013 जनवरी तक दो ऐसे पूर्व एमटेक (मेक्ट्रोनिक्स) छात्र सीएसआईआर-सीएसआईओ में पीएचडी छात्र हैं।

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